Tsunade era menor de idade quando engravidou de Minato e já havia perdido muito: seu irmãozinho e seu amante Dan. Ela estava muito assustada para amar alguém, então entregou o recém-nascido Minato para um orfanato ou para alguma família que carregasse o sobrenome Namikaze.
Vamos relembrar um pouco do passado do pai – Minato Namikaze – e da mãe – Kushina Uzumaki – do protagonista. O Clã de Kushina havia sido completamente exterminado devido ao seu alto grau de poder e pela possibilidade de se tornar uma ameaça futura.
Quem é Tsunade Senju? Tsunade é a neta do primeiro hokage, Hashirama Senju com sua esposa Mito Uzumaki, tendo parentesco com o segundo hokage, Tobirama Senju, sendo sua sobrinha-neta.
Se Tsunade tinha 24 anos quando Dan tinha 27, Minato tem 10 porque Tsunade é 14 anos mais velha que ele e Minato é 10 anos mais velho que Kakashi, e Shizune é um ano mais velha que Kakashi, então se a irmã mais nova de Dan que morreu era a mãe de Shizune, isso significa que Shizune tinha 1 ano quando Dan morreu.
Nawaki tinha 12 anos quando morreu. Tsunade tem a mesma idade que Dan, e Dan tinha 27 anos, o que significa que Tsunade tinha 26/27 anos quando Nawaki morreu. Minato morreu há 12 anos, quando tinha 24 anos.
No dia seguinte, Nawaki morreu em batalha após ser capturado em uma armadilha explosiva durante uma missão com Orochimaru e outros dois shinobi. Seu corpo foi mutilado tão fortemente que ficou irreconhecível. O colar foi recuperado por Orochimaru e dado novamente para Tsunade.
Podemos concluir que os pais de Minato são Jiraiya e Tsunade. Você deve estar se perguntando, "mas como?" veja bem. No anime, Jiraiya e Tsunade sempre conviveram juntos desde que eram crianças, então eles se conhecem a mais ou menos uns 50 anos.
Tsunade e Nawaki também são descendentes do clã Uzumaki, através da sua avó, Mito Uzumaki, esposa do Primeiro Hokage, Hashirama Senju. Tsunade e Naruto, ambos da linhagem Uzumaki, descendem de um dos Hokage e posteriormente alcançaram o mesmo título.
Uma dessas teorias que já circulou por anos entre diversos fóruns de Naruto, afirma que possivelmente Tsunade e Minato tinham algum grau de parentesco. Sendo mais específico, essa teoria propõe que Minato na verdade seria o filho de Tsunade com Dan.