Em Os Vingadores, Coulson morre após ser fatalmente ferido por Loki, coisa que o diretor da S.H.I.E.L.D., Nick Fury, usa para motivar os Vingadores a lutarem juntos.
O agente Coulson chegou a morrer no filme Os Vingadores, em 2012, e depois foi ressuscitado por Nick Fury, voltando à vida para a série, onde morreu novamente.
O filme da Capitã Marvel ocorrendo na época em que Phil Coulson era novato na S. H. I. E. L. D., e Nicky Fury ainda era jovem revela que o corpo Alienígena Usado no "Projeto T.A.H.I.T.I" foi o do Alienígena que se fez passar por Coulson e acabou morrendo e o corpo levado pela S. H. I. E. L. D.
Frank Fritz morreu dois anos após sofrer um derrame. Ele é conhecido por ter apresentado "Caçadores de Relíquias" entre os anos de 2010 e 2020. No reality, o público acompanhava suas buscas por itens raríssimos.
Enquanto os agentes tentam salvar o maior número de civis, Mack, May e Fitz vão ao resgate da menina Robin. Porém, em uma chocante reviravolta, o agente Fitz morre após um bloco de concreto cair sobre ele (esta é a morte mais chocante da série desde o falecimento do agente Triplett!).
Na midseason finale dessa temporada, vemos uma missão de resgate completa a Maveth, com Leo Fitz e Phil Coulson viajando ao planeta deserto para salvar Simmons. O ponto alto desse episódio é a morte de Grant Ward pelas mãos de Coulson (e como ele volta à vida, dessa vez como Hive).
Lance Hunter (Nick Blood) e Bobbi Morse (Adrianne Palicki) eram parte de um projeto maior da Marvel/ABC, Marvel's Most Wanted, que no fim das contas não era tão querido (sacou?) assim e foi rejeitado pela emissora. Desde a terceira temporada, nem sinal dos personagens de volta na série principal.
Skye ficou devastada quando seu colega de equipe Grant Ward se revelou como um agente da HIDRA, e se juntou ao resto do grupo para impedir o Projeto Centopeia e John Garrett. Quando Phil Coulson se tornou o Diretor da S.H.I.E.L.D., Skye o ajudou a reconstruir a organização.
Nick descobre que um aliado próximo era agente duplo enquanto Steve Rogers lida com um forte oponente: o Soldado Invernal (Sebastian Stan). Ainda assim, Fury é morto pelos inimigos. Na verdade, ele fingiu a própria morte a fim de se esconder do mundo para poder combater os remanescentes da H.Y.D.R.A.
O caso de Magneto é bastante simples: o corpo do Mutante e dos Morlocks não aparece em nenhum momento após a luta contra o grande Sentinela. Com isso em mente, existe a chance de Eric ainda estar vivo, mas escondido em algum lugar.
A série "Chicago Fire" adicionou o ator Brett Dalton (o traidor Grant Ward de "Agents of SHIELD") a seu elenco após perder Jesse Spencer, que deixou a série da rede CBS após 10 temporadas.
Mas nos minutos finais de “Maveth”, o último episódio do ano, Ward finalmente encontra sua sentença de morte pela mão – robótica – do Agente Coulson, que esmaga o peito do vilão.
Na 3ª temporada de Outer Banks, Ward Cameron sacrifica-se para salvar a filha. No entanto, muitos fãs da série ainda desconfiam que o personagem não morreu. Afinal de contas, ele (quase) morre em todas as temporadas da série, apenas para reaparecer novamente.
No episódio final, eles por fim se reúnem, quando Fitz ajuda a equipe a salvar a S.H.I.E.L.D. e a Terra da conquista por uma raça alienígena. Em entrevista por telefone, Tancharoen e Jed Whedon discutiram o final de "Marvel's Agents of S.H.I.E.L.D.". Abaixo, trechos editados da conversa. Marvel's Agents of S.H.I.E.L.D.
Fitz estava aposentado. Além do destaque para o casal, ocorreram desfechos importantes para outros personagens; veja abaixo. Coulson (Clark Gregg): Ele continua a descobir o mundo com Lola, o carro dele que ganhou ótimas melhorias. Melinda (Ming-Na Wen): A personagem virou professora na Coulson Academy.
O relacionamento delas termina mal; enquanto Verna está em seu leito de morte, Olivia acaba por perceber que foi ela quem planejou o assassinato do Presidente Fitz Grant.
