Sasori, também conhecido como Sasori da Areia Vermelha, é o primeiro membro da Akatsuki a morrer. Ele entra para a Akatsuki logo depois de virar um nukenin, ao matar o Terceiro Kazekage, para transformá-lo em uma marionete. Era um mestre tanto na criação quanto na utilização de marionetes.
Deidara ao se explodir com o C0. Irritado com Sasuke, assim como Itachi, está se recusando a aceitar o Sharingan como uma arte, e Deidara usou o C4, sua bomba mais poderosa. Ele explodiu, e pareceu ter matado Sasuke, mas foi simplesmente um genjutsu do Sharingan de Sasuke, o mesmo que Itachi tinha usado.
Com seu último suspiro ele desejava que o sonho de paz de Naruto se torne realidade e disse que em relação ao livro de Jiraiya, ele sentiu como se fosse "o trabalho de um verdadeiro deus". Assim como seu professor, Nagato morreu com um sorriso.
No final Kakashi morre para salvar aconteceu ao chouji durante o confronto com um dos seis corpos de Pain, mas será depois ressuscitou em conjunto com todos os habitantes morreram durante o ataque.
Asuma decapita Hidan, mas Kakuzu a costura no lugar, e Hidan mata Asuma. Shikamaru corre em direção a Asuma. Os dois outros ninjas do grupo são lentamente estrangulados por Kakuzu.
Itachi pressionou Sasuke para que liberasse sua marca da maldiçao, com isso Orochimaru tomou forma e foi selado pelo Susanoo de Itachi. Após isso todos o tomavam como Morto até o mangá 592 quando Sasuke após vencer Kabuto decide ir atrás de Orochimaru para Obter respostas. E declara que ele "é durão demais pra morrer".
Então,sabendo disso é possível falar que Hidan morreu um pouco depois de ser desmembrado e enterrado vivo na floresta Nara e isso pode foi comprovado no arco poder onde Kabuto cria um edo de Hidan e também foi dito no Segundo Fanbook Naruto que ele pode morrer por falta de nutrientes.
Naruto vence Pain. Após derrotar Pain, Naruto agora parte para encontrar Nagato. (Omake) Naruto e Sakura partem junto com Shikamaru, Chouji e Ino para procurar o legado do Quarto Hokage.
No entanto, Sakura tomou ataque da espada de Sasori, em vez de Chiyo. Como Sasori se preparou para atacar novamente, deu Chiyo a chance de usar os fantoches de seus pais para esfaquear Sasori através do coração na forma de um abraço, uma posição que ele sempre quis estar desde sua infância.
Após a morte de Sasori, Chiyo confessou para Sakura que ele viu o ataque e poderia ter reagido a tempo, mas preferiu não fazer nada, sucumbindo ao ataque que finalmente encerrou sua vida.
Quando Kakuzu ainda residia em sua vila, lhe foi dado uma missão muito importante, a de assassinar o Primeiro Hokage,Hashirama Senju. Mas Kakuzu foi derrotado pela Kekkei Genkai de Hashirama Senju, o Mokuton.
Neji era um poderoso membro do clã Hyuga e fez parte do convívio dos personagens desde o começo da história. Sua morte veio em meados de Naruto Shippuden, durante a Guerra Ninja: Neji saltou na frente de Naruto e Hinata para impedir que os companheiros fossem atingidos em combate.
Kisaki matou Hina, fazendo com que parecesse uma guerra de gangues. O motivo era irritá-la por ter sido rejeitada e irritar o Takemichi também. Depois disso, toda vez que Takemichi mudava os fatos de seu passado e salvava Hina, ele a matava de novo.
Chiyo então revela que ela era a pessoa que selou o Ichibi no Shukaku em Gaara, para proteger Sunagakure. Enquanto isso, a Akatsuki termina o selamento do Bijuu de Gaara, matando-o.
Indo em frente, Neji morre protegendo Hinata, o que muitos mencionaram ser um ataque fraco para morrer, mas Kishimoto mencionou claramente que ele matou Neji para aproximar Naruto e Hinata. Sério, sua morte foi tão patética, de muitas maneiras.
Quando Genma era um genin, ele foi posto num time com Might Guy e Ebisu. Durante uma missão, Genma e seus companheiros foram atacados pelos Sete Espadachins Ninja da Névoa e foram salvos por Duy, que mais tarde morreu por ter aberto todos os portões internos para protegê-los e dar-lhes tempo suficiente para escapar.
